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俄新冠病毒基因测序“翻车”:公开毒株发生200个突变,变异速度快了30倍!

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 olivia chan • 2020-04-07 14:05:46 来源:前瞻网 E7570G1

据《南华早报》报道称,俄罗斯政府的一位高级科学家证实,该国已经撤销了早前一次对新冠病毒的基因组测序结果。该结果曾显示,新冠病毒序列包含大量异常突变。

据了解,该序列样本来自圣彼得堡一名Covid-19(新冠肺炎)女性患者,由Smorodintsev流感研究所、卫生部下属的实验室和世界卫生组织合作伙伴中心联合进行,测序数据5天后提交到GISAID数据库,这是俄罗斯公开的第一个也是迄今为止唯一一个SARS-CoV-2(新冠病毒)毒株。

GISAID全称为全球共享禽流感数据倡议组织,建立于2008年5月,是由全世界一组权威的医学科学家组建,该组织致力于改善流感数据的共享。GISAID提供一个包含可以让公众访问的数据库平台。

但俄罗斯的测序结果却让人大为震惊。数据显示,与1月初中国研究人员公布的第一个样本相比,圣彼得堡毒株携带了200个突变。

而大多数其他国家的科学家发现,冠状病毒平均每个月只发生两次突变。如果俄罗斯的测序结果正确无误,那这意味着俄罗斯毒株的变异速度比正常情况快了30倍,出现了剧烈突变。

这一发现无疑将挫败全球抗击疫情的昂扬斗志。目前许多正在研发的药物和疫苗瞄准了SARS-CoV-2中的某些特定基因,而突变的异常加速可能会破坏这些努力。

该结果引起了其他国家的警觉,一些研究人员推断该测序结果存在异常。

近日,Smorodintsev流感研究所所长Andrey Vasin确认已取消上述测序结果,并解释说这些突变大多数由技术问题导致的。

他解释称,样本缺陷在基因测序过程中引发了错误。此外,数据是由机器以片段的形式生成的,并且当完整的序列由计算机组合在一起时也会出错。

目前,俄罗斯已向GISAID重新提交了一份基因测序数据,更新的序列包含七个突变,比第一次减少了96%。与其他国家相比,俄罗斯的毒株也没有出现显著差异。

新冠病毒的突变速度比季节性流感慢得多

关于SARS-CoV-2的突变速度如何,近日,有研究称,SARS-CoV-2病毒的变异速度似乎比季节性流感慢,这可能有利于科学家研制出有效的疫苗。

加州大学圣地亚哥分校计算机科学与工程助理教授Niema Moshiri撰文表示,具体来说,SARS-CoV-2的突变率每年少于25个突变,而季节性流感的突变率每年将近50个突变。

考虑到SARS-CoV-2基因组几乎是季节性流感基因组的两倍,照此计算,季节性流感的突变速度大约是SARS-CoV-2的四倍。

事实上,季节性流感猖獗如此多年却一直没有研发出有效的疫苗也恰恰在于它突变的速率过快,因此,SARS-CoV-2突变率的显著降低给我们带来了开发有效持久疫苗的希望。

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