澳科研机构开发出新型可视化平台，有助于了解新冠病毒如何“进化”

日前，来自澳大利亚国家科学机构CSIRO的研究人员公布了一种分析新冠病毒遗传序列的新方法。

这些发现将帮助研究人员更好地了解病毒株的进化方式，并帮助研究人员识别新的病毒簇。

分析新型冠状病毒的公开基因组序列全球数据将有助于我们快速了解这种复杂疾病。

以最初用于分析人类基因组的生物信息学算法为基础，研究人员开发了一种新的可视化平台来查明SARS-CoV-2病毒数千个基因序列之间的差异。

CSIRO首席执行官拉里·马歇尔(Larry Marshall)博士表示，了解基因序列至关重要。

马歇尔博士说：“我们对这种病毒了解得越多，就能越好地对付它。”

“这种对新冠病毒基因组序列进行的高度复杂分析已经帮助确定了哪些病毒株适合用于疫苗测试。目前，这些疫苗正在南半球唯一一个高生物遏制设施——位于基伦的澳大利亚疾病预防中心(Australian Centre for Disease防备)进行测试。”

澳大利亚麦考瑞大学的名誉副教授、CSIRO生物信息学小组组长，该研究论文的第一作者丹尼斯·鲍尔(David Hansen)博士说，随着病毒的进化，这一序列变得越来越重要，因为它实际上会决定病毒的行为和病毒会导致哪种疾病。

鲍尔博士还说：“全球现在有大量的单个病毒序列。”

“对这些数据点之间的进化距离进行评估和可视化，将有助于研究人员了解病毒的不同菌株——包括它们来自哪里，以及它们将会如何继续进化。”

英国约克大学名誉教授、CSIRO的危险病原体组长S.S. Vasan教授是SARS-CoV-2病毒研究和疫苗评价研究工作的领导人，同时他也是这篇研究论文的通讯作者，他说，研究人员已经对新冠病毒第一批公开的181组基因组序列进行了分析，以了解病毒的变化会对病毒的行为和影响产生怎样的后果。

Vasan教授说：“我们已经证实这种RNA病毒会进化成许多具有相同突变的独特病毒簇，我们还对其进行了可视化。”

“目前我们不认为它会影响新冠病毒疫苗、治疗方法和诊断方法的开发和评估，但随着临床前和临床研究的进展，对这个信息进行监测非常重要。”

“为了实现这一目标，我们呼吁国际研究机构在去除身份识别信息之后共享严重病例和预后的细节，以及其他相关的元数据，如共病和吸烟情况，以及病毒的基因组序列。”

CSIRO的澳大利亚电子健康研究中心首席执行官大卫·汉森(David Hansen)说，这项研究工作表明了生物信息学、基因组学、疫苗学和病毒学等既有学科和新兴学科交叉合作的重要性。

汉森博士说：“和这篇研究论文一样遵循同行评议科学过程的公开出版物是CSIRO回应病毒的一个重要组成部分。”

鲍尔博士说：“数据可视化平台的优势就在于它突出了在病毒不断变化和适应新环境的过程中仍在不断进化的基因突变。我们对病毒进化的基因差异及其对疾病进展可能会造成的后果了解得越多，我们就能更好地通过诊断和治疗来应对疾病。”

原文：https://medicalxpress.com/news/2020-04-team-evolving-strains-sars-cov-.html