从广西壮族自治区林业局获悉,我国首次获得白头叶猴全基因组序列,揭示了白头叶猴能够在富含矿物离子的高碱性喀斯特山地自然环境中长久生存的基因组遗传特征秘密。
白头叶猴(Trachypithecus leucocephalus)是一种极度濒危的灵长类动物,是中国南部广西喀斯特山区特有的物种,分布于广西左江、岷江和四方岭山脉,周围面积约200平方公里。研究其局部适应的基因组和转录组机制,有助于解释其在高度专门化生态位中的持久性。
他们首次获得了最完整的白头叶猴全基因组序列,并对基因的功能和表达进行了相应分析。研究结果表明,白头叶猴含有22对染色体,与人类23对染色体相比,少1对染色体。
在该研究中,科研人员们使用PacBio测序、光学组装和Hi-C分析,创建了一个高质量的白头叶猴基因组全新集合。注释和功能富集揭示了许多参与代谢、转运和稳态的基因,几乎所有的阳性选择基因都与矿物离子结合相关。
3个白头叶猴个体的12个组织的转录组显示,参与矿物质吸收和钙信号传导的大部分基因都得到了表达,其基因家族明显扩增。例如,FTH1主要用于铁存储,有20个扩展副本。
上述成果以《白头叶猴参考基因组和转录组分析揭示其耐碱性相关基因的扩张》(The reference genome and transcriptome of the limestone langur, Trachypithecus leucocephalus, reveal expansion of genes related to alkali tolerance)为题,于4月8日发表在《BMC Biology》上。
参考来源:https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-021-00998-2
http://lyj.gxzf.gov.cn/xwzx/xxkb/t8850624.shtml
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