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剑桥溯源新冠病毒:最原始毒株普遍存在于美国 中国流行的是变异毒株

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 olivia chan • 2020-04-10 15:40:08 来源:前瞻网 E76170G9

一场突如其来的疫情打乱了人们原本的生活节奏,目前COVID-19已成为全球大流行。而自疫情发生以来,关于“病毒从哪里来”的追问就没有停止过。

最近,剑桥大学研究人员发表在《美国科学院院刊》(PANS)上一篇针对新冠病毒溯源的研究发现,目前全球感染的新冠病毒实际上并非是同一种,而是变异分化成A、B、C三种类型,并且这三种类型的病毒在全球分布范围不同。

研究人员通过绘制2019年12月至今年3月新冠病毒的基因发展史,发现了上述三种不同但又密切相关的病毒类型;然后通过在全球范围内收集的160份感染样本发现了不同类型的新冠病毒在全球传播的轨迹。

让人比较意外的是,A型--最原始的毒株,被认为是从蝙蝠传播到人类中的新冠病毒祖先--虽然最先在中国被发现,但却在美国最为普遍。研究发现有三分之二的美国样本感染A型病毒,但其中受感染的患者大多数来自西海岸,而非纽约--纽约目前为美国疫情的“震中”。

而至于B型--被认为是经过A型在中国变异而来的--则在东亚最为普遍。在93个感染B型的样本中,除19个外,其他全部分布在中国或与中国邻近的亚洲国家。具体来看,武汉样本为22个,中国东部及其他地区为31个,与中国邻近的亚洲国家发现21个。

虽然目前关于B型为何在中国最为普遍的原因还没找到答案,但研究人员猜测可能是由于B型最能攻击中国人免疫力,因此不需要变异。

最后C型--被认为是由B型衍生而来,在中国大陆样本中不存在,但却在欧洲非常普遍。研究人员认为它可能是通过新加坡传播的。

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(图片来源:论文《Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes》)

综合上述结论,研究人员认为,为了精准攻击不同人群的免疫系统,新冠病毒正在不断发生变异。该研究可以帮助预测未来全球疫情传播和激增的热点。

不过,尽管上述研究成果得到了同行评审,但是由于它分析的样本较小——仅追踪了全球160名患者的样本,是否具有普遍性还不得而知。为了弥补这一局限,目前该研究团队已经更新了他们的数据,纳入了截至到3月底1000多例的COVID-19病例(该样本未得到同行评审)。

纽约疫情存多条传播链,但主要来自欧洲

此外,针对为何纽约感染病毒的情况与美国西海岸不同,另外两项研究给出了答案。

据位于纽约的“西奈山伊坎医学院”(Icahn School of Medicine at Mount Sinai)和纽约大学医学院分别进行的最新基因研究表明,新冠病毒早在2月中旬就开始在纽约地区传播,也就是说,在纽约第一个确诊病例出现前的几周,主要是来自欧洲的旅行者带来了这种病毒,而不是来自亚洲的旅行者。

这两个团队都从3月中旬开始,分析了来自纽约确诊病例的新冠病毒基因组。研究发现,新冠病毒较早前很有可能在隐藏的状态下传播。

研究也指出,并非所有纽约的病毒样本都来源于欧洲。其中一些似乎来自美国西海岸,而另一些似乎与亚洲直接相关。这表明纽约的疫情有许多传播链。

参考资料:https://www.pnas.org/content/early/2020/04/07/2004999117/tab-figures-data

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