前瞻基因产业全球周报第24期：俄科学家“发预告”，欲造第二批基因编辑婴儿

基因(遗传因子)是遗传的物质基础，是DNA或RNA分子上具有遗传信息的特定核苷酸序列。基因技术的应用领域包括基因检测、基因编辑、基因诊断、基因治疗和基因克隆等方面。

在上周的周报中提到，“超级细菌”是当前全球公共卫生领域面临的一个大敌，因为即便目前最强的抗生素治疗手段，都可能完败于超级细菌的抗药性。但近日，外媒报道了一件令美国医护人员感到颇为遗憾的事情 —— 他们首次在该国一名患者留存的样本中，检出了对“终极抗生素”有抗性的超级细菌基因 —— mcr-3.1 。

最近基因产业还有哪些大事发生呢?那么就来跟着前瞻经济学人一起看看吧。

俄科学家欲造基因编辑婴儿

据《Nature》报道，日前俄罗斯分子生物学家Denis Rebrikov宣布，他将进行基因编辑婴儿试验，如果获得批准的话，年底之前就开始这项计划。如果计划得以实施，他将成为全球公开的第二名进行这一试验的人。

Rebrikov是俄罗斯最大的生育诊所——Kulakov国立妇产科和围产儿医学研究中心基因组编辑实验室的负责人，也是俄罗斯国立皮罗戈夫医科大学副校长，他表示自己感到迫切需要帮助感染艾滋病毒的妇女，并且对比此前贺建奎的实验，他的技术将带来更大的好处、更少的风险、更符合道德规范、更能为公众所接受。

Rebrikov的编辑目标与贺建奎一样，同为CCR5基因。不过，贺建奎修改的是父亲携带艾滋病毒的胚胎中的CCR5基因，许多遗传学家表示，这种基因编辑几乎没有临床益处，因为父亲将艾滋病毒传给子女的风险很小。Rebrikov的计划是将被删除CCR5基因的胚胎植入HIV阳性的女性体内，以降低HIV病毒传染给胎儿的风险。

根据Rebrikov的说法，他已经与一个艾滋病毒中心达成了协议，将招募那些感染了艾滋病毒的想要参加实验的女性。

学术界对于Rebrikov的计划普遍持反对态度，他们认为：编辑胚胎中的CCR5基因的益处未必大于风险，并且胚胎基因编辑的安全性本身值得担忧。

关于基因编辑，俄罗斯在这方面的法律规定模糊不清。许多国家都禁止植入基因编辑过的胚胎。俄罗斯的一项法律规定基因工程大多数情况下应该被禁止在，但目前尚不清楚是否或如何在胚胎基因编辑方面强制实施这些规则。对俄罗斯一系列国家法规的分析发现，俄罗斯关于辅助生殖的规定没有明确提及基因编辑。

Rebrikov预计，俄罗斯卫生部将在未来9个月内澄清关于胚胎基因编辑临床应用的规定。他非常想帮助感染艾滋病毒的妇女，甚至想要在俄罗斯制定法规之前就试图继续他的实验。

为了减少他因实验而受到惩罚的机会，Rebrikov计划首先寻求包括卫生部在内的三个政府机构的批准。这可能需要一个月到两年的时间。

自媒体造谣“基因数据外流”案宣判：向华大基因公开道歉

6月21日，华大集团通过官方微博发表声明，就华大起诉自媒体“记者金微”名誉侵权一案，已于当日收到深圳市盐田区人民法院的判决书。判决认定，被告金微侵害华大名誉权属实，并要求其向原告华大公开道歉。至此，此前受到舆论广泛关注的“14万孕妇基因组已流出国外”事件以自媒体造谣误导公众告终。

判决书裁定：“记者金微”发布的《华大基因被罚!14 万孕妇基因组已流到国外，细思极恐!》、《华大基因，我不是谣言自媒体》部分内容误导公众认为原告将基因检测数据非法泄露到国外的情况。被告将其发布在互联网上，使得原告的社会评价被降低，名誉遭到侵害，认定被告构成对原告名誉的侵权。

中国科学家完成草地贪夜蛾染色体级别的基因组测序和组装

我国科学家完成草地贪夜蛾染色体级别的基因组测序和组装，目前基因组数据已经面向全世界公开下载使用。科学家们还研究发现了多种防控草地贪夜蛾的有效“武器”。

云南农业大学、深圳华大基因、中国科学院动物研究所、中国农业科学院等研究机构通力合作，与国内各省区及美国样本互动，共产出1.5太(TB)的基因组测序原始数据，目前已经完成了一雌一雄两个染色体水平的基因组组装，大小分布达到542.42兆和530.77兆。

迈向“高清”基因组 | 华大发布“676”高精度基因组标准及解决方案

6月15日，在欧洲人类遗传学大会(ESHG 2019)上，全球领先的生命科学前沿机构华大集团(以下简称“华大”)发布了“高清”组装基因组解决方案及标准，该方案及标准基于华大旗下子公司华大智造自主测序技术DNBSEQTM和stLFR，开启了基因组测序“全高清”时代，对更全面和准确地获取遗传信息有着里程碑式的突破。

在大会现场，华大智造首席科学家Rade Drmanac博士向在场嘉宾阐述了华大定义“高清”基因组的“676”标准，如果说过去短读长测序比对参考基因组，绘制出的是一幅打着“马赛克”的“肖像画”，那么基于“676”标准的从头组装二倍体基因组数据，则将基因组测序真正带入“全高清”时代，将极大推动个性化医疗的发展。

牛羊鹿为啥会长角 西农科学家团队揭开反刍动物基因秘码

6月21日，国际学术期刊《科学》杂志在线刊发了西北农林科技大学动物科技学院姜雨教授研究团队与西北工业大学等9家国内外单位合作的研究论文《反刍动物角发生发育和鹿茸快速再生的遗传基础》。从遗传学角度首次提出反刍动物的角具有相同的细胞起源——头部神经脊干细胞，其发育过程利用了基本相同的基因调控通路，为反刍动物角具有单一的进化起源和发生发育机制提供了证据。

此外，研究还发现，多个原癌基因通路在鹿角组织被激活并发生遗传改变，可能在调控鹿茸快速再生过程中发挥重要作用，同时几个重要的抑癌基因也发生了鹿科特异的遗传改变，其可能强化了抑癌作用。因此，进一步的功能研究将在证明快速但受控的细胞生长的潜在机制以及探索鹿作为器官再生模型和癌症模型方面具有重要的科学意义，为癌症治疗和预防提供新的思路和方法。

欧盟“反转中坚力量”瑞士批准一项转基因大麦田间实验

瑞士联邦环境办公室(FOEN)于6月12日批准了苏黎世大学在瑞士境内进行一项转基因大麦田间实验。而瑞士一直被认为是对转基因限制最严格的国家。

FOEN发布的公告显示，苏黎世大学需要在严格的条件下，进行对转基因大麦真菌病抵抗力的研究。作为实验申请方，苏黎世大学必须采取包括控制种植区距离、实验后销毁实验材料等一系列措施，确保人类、动物和环境的安全，并防止转基因材料在实验区外扩散。

美国研究团队发现青蒿素有助治疗先天性耳聋

中国科学家根据中医药文献研究发现的青蒿素已成为“抗疟明星”。一项新研究发现，除了治疗疟疾，青蒿素可能还有助于治疗特定基因突变导致的先天性耳聋。

耳朵中的毛细胞是很多动物平衡系统和听觉系统的关键细胞，它可以把声波振动转化为能被神经传输的信号，大脑收到这些信号后再“翻译”成有用信息。然而，一种特定基因突变会使毛细胞失去功能，从而导致失聪、平衡障碍等。

美国凯斯西保留地大学研究人员在美国《国家科学院学报》上报告说，他们以存在这种基因突变的斑马鱼为实验对象，发现青蒿素有助于重建内耳的听觉细胞功能，它可以使斑马鱼内耳中产生更多的有用蛋白质，帮助毛细胞重新建立起听觉连接。

葛兰素史克与基因编辑先驱Doudna合作，创立基因组学研究实验室

世界知名生物技术公司葛兰素史克(GSK)宣布与加州大学(UC)签署了一项为期五年的合作协议，双方共同建立一个先进的实验室(LGR)，用以探索基因突变如何引起疾病的内在病理机制，并致力于开发新的CRISPR基因编辑技术以加速研发出新疗法。GSK表示，他们将派遣人工智能和机器学习小组帮助LGR创建生成数据所需的计算工具，其目的在于让LGR实现自动化CRISPR基因编辑，从而可以进行大规模基因分析来识别遗传变异与疾病。而LGR的研究人员则需要选择最有可能受益的患者进行临床试验，从而加速新疗法的开发。该实验室将设在旧金山的伊利诺伊大街，靠近加州大学旧金山分校的Mission Bay校区。

科学家发现导致早产的关键基因

根据最近一项研究，编码SLIT2的基因突变(SLIT2是一种在胎盘中胎儿细胞中表达并参与指导胎儿神经系统生长的蛋白质)，可能通过激活母体的免疫系统而导致早产。奥卢大学的MikaRämet及其同事将相关研究于6月13日发表在《PLOS Genetics》杂志上。

该分析指出了一种名为SLIT2的蛋白质的基因变异，该蛋白质有助于在发育过程中引导神经元的生长，并且能够与ROBO1的受体蛋白质结合。研究人员表明SLIT2和ROBO1在早产儿胎盘中的表达水平较高。此外，在使用胎盘组织细胞培养的实验中，研究人员发现ROBO1在调节与感染，炎症和免疫反应相关的几种妊娠相关基因中发挥作用。

Nature：新型基因编辑工具完成”精准“编辑

在最近一项研究中，哥伦比亚大学的一项新发现可以解决当前基因编辑工具(包括CRISPR)的一个主要缺点，并为基因工程和基因治疗提供了一种强有力的新方法。

他们的新技术称为INTEGRATE，即利用细菌跳跃基因将任何DNA序列准确地插入基因组而不切割DNA。目前的基因编辑工具依赖于切割DNA，但这些切割可能导致错误的发生。相关结果发表在最近的《Nature》杂志上。

Science子刊：揭示基因SIGLEC15是复发性外阴阴道念珠菌病的易感性因子

在一项新的研究中，来自荷兰拉德堡德大学、格罗宁根大学、马斯特里赫特大学;意大利泰拉松遗传学与医学研究所、佩鲁贾大学;德国莱布尼茨自然产物研究与感染生物学研究所;中国青海师范大学、深圳华大基因研究院;美国韦恩州立大学;罗马尼亚克莱奥瓦医药大学的研究人员鉴定出一些基因和细胞过程有助于促进复发性外阴阴道念珠菌病(recurrent vulvovaginal candidiasis, RVVC)---一种由真菌白色念珠菌(Candida albicans)感染引发的疾病---产生。

相关研究结果近期发表在Science Translational Medicine期刊上，论文标题为“A systems genomics approach identifies SIGLEC15 as a susceptibility factor in recurrent vulvovaginal candidiasis”。在这篇论文中，他们描述了对女性中这种真菌感染的研究以及他们从中学到了什么。

质粒介导的抗生素抗性基因的环境扩散研究获进展

人类病原菌中抗生素抗性水平的升高给全球人类的健康带来了巨大的威胁。由于可用药物不能有效杀死耐药性致病菌，全球每年约70万人死于耐药菌感染。除了临床环境，土壤中检测到的抗生素抗性基因的多样性和丰度也在不断攀升。

与以往环境领域所关注的重金属、有机污染物等不同，抗生素抗性基因这一新型污染物不仅能在宿主细菌中伴随细菌增殖而增加丰度，还会通过基因突变和基因水平转移增加多样性、宿主范围及丰度。质粒接合是基因水平转移的三大机制之一，其所携带的全部基因在接合过程中复制增加，使原宿主及受体都拥有这些基因，因此在推动抗生素抗性基因的环境扩散乃至病原菌扩散中起着重要作用。

中国为什么要建世界最大基因库?

2016年9月22日，筹建4年的位于深圳大鹏新区的国家级基因库正式运营，这是我国唯一一个获批筹建的国家基因库，也是继美国国家生物技术信息中心(NCBI)、欧洲生物信息研究所(EBI)、日本DNA数据库(DDBJ)之外全球第四个国家级基因库。

基因资源是国家战略资源，也是中国参与未来新生物经济竞争的源头资源。目前，美国、欧盟、日本等发达国家和地区先后建立了大型基因数据库，这些大基因数据库的生物信息数据几乎涵盖了所有已知的DNA、RNA和蛋白质数据，将在未来生命科学大数据时代对基因资源的开发利用形成优势。

在此背景下，中国国家基因库应运而生，融合近年来生命科学学科前沿新态势，结合国际发展新动向，形成“三库两平台”结构及功能。“三库”由贯穿全生命周期的基因信息数据库、生物样本资源库和生物活体库组成，“两平台”为数字化平台、合成与基因编辑平台。

不同于国外的基因库，中国国家基因库的“三库两平台”定位涵盖了基因库基本的功能属性，并在综合性上有所超越。中国国家基因库执行主任徐讯在接受媒体采访时说：“实际上跟他们相比，我们是综合性的，而他们是一个单一能力的数据库，第二他们这些数据库主要是以科研为主，我们这个数据库不仅仅是有科研的数据，还有产业的数据，它不仅仅面向科研，同时也面向产业，给产业机构提供服务和支持。”

深圳国家基因库执行主任、华大基因研究院院长徐迅曾表示，深圳国家基因库是全世界最大的综合性基因库。生命科学时代的核心资源是基因，拥有更多基因资源并予以认知利用，意味着我们将拥有更大的优势。未来我们可以通过基因库搭建起基因资源挖掘的基础性支撑平台，来聚焦生物医药、生物农业、微生物和海洋生物等领域，极大缩短基础科研到科技成果转化应用的周期。我们还可以将生物活体库打造成中国的‘诺亚方舟’，保护和保存全球约30万种植物、百万种动物以及近千万种微生物活体资源。

目前，中国国家基因库已存储多种生物资源样本1000万份，初步建立基因信息数据和生物样本采集、存储、管理相关标准和技术规范。徐讯透露，接下来将联合全国各个省市、地区一起启动百万云健康队列的项目，从而为母婴健康的精准医疗提供数据库的服务：“我们还将联合全国各个省市、地区一起启动百万云健康队列的项目，从母亲怀孕到小孩4岁中间的关键点对母亲和小孩的关键的遗传信息、关键的生物样本和一些生理特征进行详细的保存，以此建立起母婴健康最强的队列，同时对母婴健康的精准医疗提供数据库的服务。”

安吉康尔完成3000万元人民币A轮融资，以基因智能助力遗传疾病精准诊断

近日，安吉康尔(深圳)科技有限公司宣布公司已完成A轮3000万元人民币融资。本轮融资由合创资本领投，原投资方持续增持，星汉资本担任独家财务顾问。安吉康尔成立于2017年2月，致力于遗传疾病精准诊断和筛查业务，是中国妇幼保健协会在精准医疗领域的唯一会员单位。

根据《企查猫》资料显示：AEGICARE安吉康尔(深圳)科技有限公司总部位于深圳市南山区科技园，是一家致力于建立基于基因大数据的精准医疗人工智能平台，和推动包括肿瘤和遗传病在内的人类基因组疾病研究和治疗的创业公司。公司核心团队来自于北京大学生物医学工程系、清华大学计算机系、军事医学科学院、美国伊利诺伊大学香槟分校生物医学工程系、美国卡内基梅隆大学计算机系等国内外顶级院校，有十余年的生物信息学、高通量测序、临床遗传学及人工智能学术和业界经验。

Adaptive拟IPO融资2.3亿美元，与微软、基因泰克合作开发T细胞和免疫疗法

近日，生物技术公司Adaptive Biotechnologies(以下简称Adaptive)计划在纳斯达克证券交易所上市，股票代码为ADPT，拟IPO融资2.3亿美元。据悉，Adaptive计划出售1250万股，每股价格在15-17美元之间。本轮融资所得资金将被用于推进该公司针对人体免疫系统开发相关疗法和诊断测序测试。

Adaptive由Chad和Harlan Robins两兄弟于2009年成立，总部位于美国华盛顿州西雅图，是高通量测序领域的先驱性公司和领军企业之一。该公司擅长结合生物信息学来鉴定分析T细胞和B细胞受体。Adaptive正在与微软合作，利用机器学习创建图册，绘制免疫系统与多种疾病之间的相互作用，以开发血液检测技术。该技术通过筛检免疫系统内的疾病征兆，可以及时诊断出难以察觉的疾病。Adaptive还在2018年年底与基因泰克签署了一项价值21亿美元的合作协议。根据协议，两家公司合作开发针对肿瘤的T细胞疗法。