一项新的基因指纹研究显示,去年2月在波士顿举行的一场生物技术会议已经被标记为Covid-19超级传播事件,在美国和欧洲导致了至少24.5万例其他病例。
马萨诸塞州布罗德研究所的研究小组报告说,一个单一的病例似乎是导致其他许多最终病例的原因。
他们的研究发现了与这次会议有关的病毒的两种特殊的基因指纹,然后在全美范围内追踪这些病毒的谱系。
其中一种“从波士顿出口到美国至少18个州以及其他国家,包括澳大利亚、瑞典和斯洛伐克,”由布罗德研究所病原体基因组监测主任布朗温·麦金尼斯(Bronwyn MacInnis)领导的团队在《科学》(Science)杂志上写道。
其中一个尤其糟糕。
一种携带突变基因的病毒——一种被标记为C2416T的微小基因变化——显然是由一个人带到会议上的,最终感染了24.5万人。
病毒株的一个子集,一种名为G26233T的变异病毒导致了这其中的88,000例病例。
该团队写道:“一次引入对随后的传播产生了巨大的影响,因为在疫情爆发的早期,在许多公共卫生预防措施到位之前,它在高度流动人口中的过度传播被放大了。”
他们补充说:“虽然马萨诸塞州是最早与会议有关的传播地,但总的来说,佛罗里达州是最大的传播地。”
很难记录一个超级传播的事件。研究人员必须证明人们被感染了,并且彼此之间有接触。当成千上万或数十万人参与其中时,这几乎是不可能的。
但是基因指纹技术使它成为可能。
Broad团队使用病毒数据库来追踪这些被称为单核苷酸多态性或SNPs的个体变化。
2月下旬,只有大约200人参加了在波士顿举行的会议,该会议是在大范围流行病预防措施到位之前举行的。
C2416T突变可能起源于美国以外。
研究人员检查了全球新冠病毒样本数据库,并在2月29日确诊的两名法国患者身上发现了这种病毒。
在美国,仅在3月份前与该会议有关的患者中发现。
研究人员写道:“综上所述,这强烈表明,在等位基因(突变)通过一次引入来到波士顿之前,C2416T在2020年2月在欧洲的低水平社区传播,然后在会议上通过过度传播而被放大。”
换句话说,一个人携带了这种特定的病毒到波士顿,它通过会议传播。
研究人员称,第二个病毒指纹G26233T似乎是在这次会议上诞生的。
他们写道:“在与会议有关的案例发生之前,在任何公共基因组数据库中都没有发现这种情况。”
这些特殊的指纹可以方便地从单个事件跟踪病毒的传播。
C2416T突变在波士顿地区迅速传播,在早春波士顿地区四县采集的样本中,出现在30%到46%的样本之间。
“到2020年11月1日,有29个州发现了含有C2416T的病毒。”
编译/前瞻经济学人APP资讯组
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